وكان السيد الشامي هادفاً في عمله وشديداً ضد فكر ومخططات حزب البعث، وصلباً في المواجهة ضد مشروعه التخريبي الذي كان يستهدف الإسلام من داخله، ويسعى لتصفية الحوزة العلمية واستئصال أبناء الحركة الإسلاميّة التي أسّسها الإمام الشهيد الصدر والثلة الواعية التي أحاطت به، حتّى أنَّه أصدر قراراً مشؤوماً يقضي بإعدام كل المنتمين لحزب الدعوة والمروّجين لأفكاره، وبأثر رجعيّ، وهو قرار لم يسبق له مثيل في التأريخ.

وفي هذا الجو من إرهاصات الصراع وبدايات المواجهة، فقد شن النظام البعثي حملة اعتقالات واسعة طالت كثيراً من العلماء ورموز الحركة الإسلامية وشبابها الحركيين، وقد تقدّم الحديث عن اعتقاله وحكمه بالتّفصيل.

المؤسسات الثقافية والاجتماعية والخيرية

لقد عرف السيد الشامي بتفكيره المؤسساتي ونشاطاته الاستراتيجية لتأسيس المشاريع والمؤسسات الخيرية والثقافية والتعليمية بمختلف المواقع والساحات التي تحرك فيها سواء أكان ذلك في بلدان المهجر أم في الوطن الأم العراق، وهي:

• مؤسس ومدير مدرسة عشرة الفجر 1982م في مدينة قم المقدّسة بالاشتراك مع سماحة المرحوم الخطيب الشيخ عبد المجيد الصيمري (رحمه الله) وهي مدرسة إسلامية علمية حوزوية تهتم بإعداد العلماء والخطباء والمرشدين في المهجر
• الحسينية الحيدرية في الشام 1984م: بالتعاون مع سماحة الشيخ المرحوم عبد المجيد الصيمري (رحمه الله) لتكون ملتقى ثقافيّاً واجتماعيّاً ومركزاً لإقامة المجالس الحسينيّة وإحياء المناسبات الخاصة والعامة في بلاد الشام
• حسينية المصطفى في لندن 1987-1992م: وهي مركز إسلامي ومنتدى اجتماعي تلتقي فيه الجالية الإسلامية العراقية بجميع أطيافها، وتقام في هذا المركز صلاة الجماعة والعيدين والمجالس الحسينية والندوات الثقافية وإحياء المناسبات الخاصة والعامّة
• مؤسسة دار الإسلام الثقافية الخيرية في بريطانيا 1992م: وهي مؤسسة تقوم بنشاطات وبرامج متعددة لخدمة الجالية الإسلامية عموماً، والعراقيّة على وجه الخصوص مثل تقديم الخدمات الاستشارية والقانونيّة للمهاجرين العراقيّين، إضافة إلى قضايا الأحوال الشخصية وإقامة صلاة الجمعة وإحياء المناسبات في شهر محرم الحرام، وشهر رمضان المبارك، وغيرها من المناسبات؛ ولهذه المؤسسة فرع في مدينة مانجستر شمال بريطانيا يقوم بالنشاطات والبرامج نفسها، ولها فرع آخر في العراق، كما أنَّ مؤسسة دار الإسلام هي الجهة المعتمدة لجامعة الإمام جعفر الصادق (ع) أمام وزارة التعليم العالي والبحث العلميّ من الناحية القانونية
• ديوان الوقف الشيعي 2003م: بعد مرحلة التحول والتغيير التي شهدها العراق بعد سقوط النظام البعثي وانحلال وزارة الأوقاف والشؤون الدينية كان للسيد الشامي الغالبي دور كبير ومتميز في تأسيس ديوان الوقف الشيعي ووضع برنامج واسع لتشكيلاته الإدارية والمالية والثقافية وهيئاته المختلفة وإعداد مسودة قانونه الأساسي، حتى أصبح ديوان الوقف الشيعي مؤسسة كبيرة ذات أعمال ونشاطات ثقافية واجتماعية وعمرانية متنوعة
• هيأة الشهيد العراقي للخدمات الإنسانية 2003م: وهي جمعية خيرية قدمت الخدمات الإنسانية والمساعدات العينية للفقراء وأبناء الشهداء وذوي الاحتياجات الخاصة، وقد قامت هذه الجمعية بعدة حفلات زواج جماعي إذ بلغ عدد المتزوجين من قبل هذه الهيأة 1550 حالة زواج موثّقة خلال أقل من سنتين
• جامعة الإمام جعفر الصادق (ع) الأهلية 2004م: وتضم عدة كليات وأقسام في مختلف الاختصاصات العلمية والأدبية، وهي الآن أكبر جامعة أهلية في العراق؛ إذ ترتبط بها عدة فروع في محافظات العراق، وهي: ميسان، ذي قار، المثنى، النجف الأشرف، ديالى، صلاح الدين، كركوك، إضافة إلى مقرها الرّئيسي في بغداد
• الأمين العام لمؤسسة البلاغ والإرشاد الإسلامي، وهي مؤسسة تعنى برعاية الطلبة والمبلغين وخطباء المنبر الحسيني الشريف في العراق منذ تأسيسها عام 2008م ولمدّة سنتين
• مجمع دار الإسلام الثقافي الخيري بغداد 2007م: وهو مجمع كبير في منطقة العطيفية من كرخ بغداد يضم مسجداً وقاعة مناسبات ومدارس تعليمية ومركزاً للرعاية الطبية، ومطعماً، ومكتبة مركزيّة ومجمّعاً سكنيًا ومطبعة وداراً للنشر ومكاتب إدارية وملاعب وساحات ترفيهية